El ATmega del arduino solo tiene un puerto serie por hardware. Si no te incluyera el acceso por los pines Rx y Tx no podrias usar el puerto serie del ATmega para conectar por ejemplo un LCD serie o cualquier otro componente. Como el arduino se programa por el puerto serie pues tambien han incluido en la placa un conversor USB-RS232 que esta tambien conectado al puerto serie del ATmega. Si no fuera asi tendriamos que usar otra placa que conectariamos al ordenador y despues a los pines Rx, Tx. Si por ejemplo haces uso del serie a traves del USB no te funcionara la conexion serie con otro componente externo a traves de los pines Rx, Tx. Asi que hay que tener cuidado, si conectas algun componente que se comunique por el puerto serie con el arduino (pines Rx, Tx) no podras usar el "Serial.print" para enviar datos de depuracion por el puerto serie al ordenador. Como nota, existe una libreria de implementacion de puerto serie por software con lo que podras usar otros pines del arduino para realizar comunicaciones serie.